Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms