Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRF1Q92994 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRF1Q92994 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRF1Q92994 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRF1Q92994 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRF1Q92994 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRF1Q92994 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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