Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms