Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms