Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER1Q8TC90 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms