Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL11Q8NHH1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms