Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms