Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms