Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms