Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms