Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTL3Q8N8U3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms