Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVOPQ8N4V2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms