Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP4Q8N2S1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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