Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms