Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXM7

ODF3L1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L1Q8IXM7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3L1Q8IXM7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms