Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms