Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM47EQ6ZV65 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM47EQ6ZV65 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM47EQ6ZV65 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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