Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms