Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A10Q6U841 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms