Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms