Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms