Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RTL6Q6ICC9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RTL6Q6ICC9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RTL6Q6ICC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTL6Q6ICC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL6Q6ICC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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