Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms