Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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GFI1BQ5VTD9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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