Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms