Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC39AQ5SRH9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms