Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms