Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms