Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms