Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms