Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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