Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms