Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms