Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms