Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms