Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms