Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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