Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms