Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GABRA6Q16445 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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