Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN9AQ15858 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN9AQ15858 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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