Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1CQ15572 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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