Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF11Q15544 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TAF11Q15544 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF11Q15544 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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