Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPRRQ15256 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRRQ15256 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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