Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms