Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTAN1Q13813 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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