Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOFQ13790 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOFQ13790 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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