Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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