Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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MKRN4PQ13434 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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MKRN4PQ13434 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MKRN4PQ13434 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MKRN4PQ13434 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MKRN4PQ13434 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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