Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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