Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SEMA3FQ13275 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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